Για την Καθολική Εκκλησία, την Ορθόδοξη Εκκλησία και άλλες εκκλησίες, το ιερό νερό είναι αυτό που έχει ευλογηθεί από τον ιερέα και που βρίσκεται στη βαπτιστική γραμματοσειρά. Αυτό το νερό είναι ξεχωριστό αφού συμβολίζει την αγνότητα, χρησιμοποιείται συχνά κατά τη διάρκεια των βαπτίσεων των μωρών, ως ένδειξη καλωσορίσματος στην οικογένεια της Καθολικής Εκκλησίας. Όταν οι άνθρωποι μπαίνουν στους ναούς, βρέχουν τα δάχτυλά τους με ιερό νερό και κάνουν το σημάδι του σταυρού.
Το νερό για την Καθολική Εκκλησία αντιπροσωπεύει ένα από τα πιο υπέροχα λειτουργικά στοιχεία, όχι μόνο για τα φυσικά χαρακτηριστικά του, αλλά και για τον σημαντικό ρόλο του στην ιστορία του ανθρώπου. Το νερό μετατρέπεται σε μυστήριο όταν λαμβάνει μια ειδική ευλογία. Με αυτόν τον τρόπο γίνεται ιερό νερό, αποκτώντας την αρετή να αποτρέψει τον διάβολο, να θεραπεύσει τους άρρωστους και να καθαρίσει.
Όταν οι Καθολικοί κάνουν το σημάδι του σταυρού με τα δάχτυλά τους βυθισμένα σε ιερό νερό, θυμούνται ότι έχουν καθαριστεί μέσω του βαπτίσματος.
Εκτός αυτού, το ιερό νερό αντιπροσωπεύει το άγιο πνεύμα. Ως εκ τούτου η εκκλησία το χρησιμοποιεί στις περισσότερες εκκλησιαστικές λειτουργίες.
Το ιερό νερό χρησιμοποιείται με συγκεκριμένες εκφράσεις, για να ευλογεί σπίτια, εικόνες, ωμοπλάτες κ.λπ. Κατά τη διάρκεια της λειτουργίας, τοποθετούνται μερικές σταγόνες νερό στο κρασί, το οποίο αργότερα γίνεται το αίμα του Χριστού και προκαλεί ότι βγήκε από την πλευρά του Ιησού τραυματισμένο με δόρυ, που αντιπροσωπεύει την ένωση της ευλογημένης φύσης στο πρόσωπο του ρήματος και της ολοκλήρωσης όλων των πιστών στο πνευματικό σώμα του Χριστού.
Το ιερό νερό λέγεται ότι είναι μυστήριο επειδή είναι ένα ιερό σημάδι με το οποίο εκδηλώνονται, συνήθως πνευματικά, αποτελέσματα μέσω της μεσολάβησης της εκκλησίας. Δηλαδή με τη χρήση μυστηριακής, όπως στην περίπτωση του ιερού νερού ή της ευλογίας ενός ατόμου. Ο Χριστιανός ευνοείται από τα πνευματικά αγαθά που η εκκλησία προστατεύει ως θησαυρός που ο Θεός τους έχει δώσει για να διαχειρίζονται σε όλους τους ανθρώπους.
