Ο κύκλος των ωοθηκών (ή εμμηνορροϊκός κύκλος) είναι η διαδικασία ωρίμανσης των ωοθηκών, οι ωοθήκες είναι τα γυναικεία αναπαραγωγικά κύτταρα που εκκρίνονται από αδένες που ονομάζονται ωοθήκες, τα οποία φορτώνονται με το ήμισυ του αριθμού των φυσιολογικών χρωμοσωμάτων και μπορούν να γονιμοποιηθούν από το σπέρμα. (αρσενικό αναπαραγωγικό κύτταρο) που έχει την ένωση παράγει το σχηματισμό ενός αυγού ή ζυγώτη που εμφυτεύεται στο εσωτερικό στρώμα της μήτρας που ονομάζεται ενδομήτριο, για εννέα μήνες για να δώσει το σχηματισμό ενός εμβρύου.
Ο κύκλος των ωοθηκών διαρκεί περίπου 28 ημέρες (αν και μερικές γυναίκες έχουν 21 έως 35 ημέρες), η σαφέστερη εκδήλωση ότι ο κύκλος των ωοθηκών λαμβάνει χώρα είναι με την εμφάνιση της εμμήνου ρύσεως (μηνιαία αιμορραγία μέσω του κολπικού σωλήνα). Η μέτρηση του κύκλου των ωοθηκών ξεκινά την πρώτη ημέρα της αιμορραγίας και τελειώνει την ημέρα πριν επανεμφανιστεί η αιμορραγία.
Ο κύκλος των ωοθηκών συμβαίνει με αυτήν την αιμορραγία για έναν απλό λόγο, κάθε μήνα η ωοθήκη θα εκκρίνει ένα ωάριο (αυτή η διαδικασία είναι γνωστή ως ωορρηξία) αυτή η έκκριση εμφανίζεται περίπου 14 ημέρες πριν ή ημέρες της εμμήνου ρύσεως σε περίπτωση που ληφθεί ένα παράδειγμα γυναίκα με κύκλο ωοθηκών 28 ημερών. το αποβληθέν ωάριο κατεβαίνει μέσω των σαλπίγγων έως ότου φθάσει στη μήτρα που εκτίθεται σε γονιμοποίηση, εάν δεν γονιμοποιηθεί, το ωάριο θα αποβληθεί από τη μήτρα μαζί με την απολέπιση του ενδομητρίου μέσω του κολπικού σωλήναΑυτή είναι περιγραφική εμμηνόρροια, επομένως μπορεί να αναγνωριστεί ότι η γόνιμη περίοδος μιας γυναίκας είναι η ημέρα της ωορρηξίας που αναφέρθηκε παραπάνω, καθώς και ένα περιθώριο κινδύνου 3 έως 5 ημέρες πριν και 1 έως 2 ημέρες μετά την ωορρηξία.